根据协议，双方将共同推进农科教、产学研协同创新机制，加快提升合作区域超级杂交稻生产水平与种植面积，推广经农业部确认的超级稻品种，努力实现超级稻大面积“绿色安全高产高效”目标。同时开展双季超级杂交稻每公顷22.5吨的高产攻关。国家杂交水稻工程技术研究中心每年提供2-3个左右超级杂交稻苗头组合参加广东省区试，并参加项目试验、示范。另外，将双方第一阶段合作研究成果——国家杂交水稻工程技术研究中心培育的抗稻瘟病新品种—Y两优143和Y两优305作为合作项目主推品种在广东适宜的生态区域大面积推广。
为确保项目的顺利实施，该项目依托国家杂交水稻工程技术研究中心和广东省水稻产业技术体系创新团队，成立了以袁隆平院士为组长的“项目指导专家组”和以钟旭华研究员为组长的“项目实施专家组”。
2009年，广东省农业厅与国家杂交水稻工程技术研究中心签约“超级杂交稻高产示范工程项目”，合作建设超级杂交水稻示范基地，经过不懈努力，累计试验示范新品种（组合）16个，示范应用面积1046万亩，超级杂交稻新组合Y两优143通过了广东省品种审定；构建和集成了12项超级稻高产优质友好型栽培技术，示范推广综合配套生产技术23项；特别是高产示范实现历史性突破，2013年乐昌市梅花镇的一季晚稻超级杂交稻示范片项目首破单产800公斤的记录，今年，在梅州兴宁市创造了超级稻年亩产3075斤的世界记录。
袁隆平表示，广东是科技强省，也是农业强省，广东的条件适合种植双季稻。双季超级稻年亩产3000斤的梦想就是在广东实现的，希望未来通过合作，再次先期实现单季稻每公顷17吨、双季稻每公顷25吨的目标产量。